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广东省妇幼保健院小儿胸外科是在医院领导的亲自关怀下，在结合医院小儿外科基础上综合胎儿医学和新生儿外科专业融合创建的。科室拥有主任医师一人，副主任医师二人，硕士研究生4人。科室俞钢主任是医院小儿外科的学科带头人，也是小儿胸外科的创始人，创立了国内第一个以胎儿、新生儿和小儿的纵向胸部疾病的综合管理体系，在胎儿肺发育性疾病方面独树一帜的运用了产前诊断和出生后的早期干预模式，并成功的应用了互联网+的医学模式，为全国甚至全球的病人提供医学帮助和诊治。科室拥有先进的小儿外科及胸外科设备，专业技术力量雄厚。近几年，已经完成近500余例的小儿胸外科手术，且2个月内的小婴儿占30%。科室设病房床位40张，其中监护室床位12张。配套的科室有遗传实验室、肺功能检查室、支气管纤维镜室等，配套的设备有进口人工常频-高频呼吸机、一氧化氮机、多参数多功能心电监护仪、床边超声机、彩色超声心动图、床边X线机、起搏器、输液泵、血气分析仪等先进诊疗设备，手术配套有3mm、5mm胸腔镜、手术能量平台、ERBE胸外科超级工作站、热能刀、超声刀等。目前年完成小儿胸外科手术量300余台。

目前医院小儿胸外科已广泛开展各年龄段、各种先天性肺部疾病的手术包括：先天性膈疝的胎儿-新生儿一体化管理以及微创治疗；先天性肺发育畸形的产前诊断和评估以及新生儿期的胸腔镜微创手术是目前科室的主要特色，也处于国内领先水平。胸外科手术涉及小儿胸腔的各个器官，如纵隔、肺、气管、心包、膈肌、胸腔、胸壁等先天性疾病的微创外科手术。目前开展的手术有：微创辅助肺叶切除术、肺段切除术（亚肺切除术）、肺肿瘤切除术、微创纵膈肿瘤切除术、支气囊肿切除术、隔离肺切除、膈肌下隔离肺经胸微创切除术、微创肺活检术、膈疝微创修补术、膈膨升修复术、食道裂孔疝微创修补术、漏斗胸矫形术等。

医院自2014年起在国内率先开展婴幼儿先天性肺部疾病，包括先天性肺囊腺瘤、先天性肺隔离症、先天性膈疝等出生缺陷疾病的微创手术治疗。经胸壁微创小切口完成手术，具有不损伤胸骨，创伤小，位置隐蔽，、美观以及恢复快等优点，并在一定程度上也可减轻对患儿将来的心理影响，临床效果良好。