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学术前沿

基因突变特征预测NSCLC免疫治疗收益

发表者:张建东 108人已读

免疫治疗目前研究发展中存在一个很重要的问题,就是找到精准预测患者治疗收益的生物学标志物。现在临床常用预测免疫检查点抑制剂(ICI)治疗收益的生物学标志物是PD-L1。其他比如肿瘤突变负荷(TMB)、MSI等。FDA在今年已批准将Pembrolizumab应用于TMB-H(≥10muts/Mb)的实体瘤患者。但是,目前关于精准预测ICI疗效,仍任重而道远。今天分享一篇JTO近期发表的文章,研究者假设特定的基因突变可能比TMB-H是更好的预测NSCLC免疫治疗的生物学标志物。山东第一医科大学第一附属医院(山东省千佛山医院)肿瘤放疗科张建东

研究方法

根据最近发表的350例NSCLC患者队列数据,研究者编制了一份候选基因列表,这些候选基因可能预测ICI治疗的收益。评估候选基因的不同突变特征对ICI疗效的影响,并与TMB-H进行比较。然后在ICI治疗的NSCLC患者独立队列中验证不同突变特征的预测能力。(制定候选基因列表的标准:该基因必须在≥3例患者中发生突变;基因突变与生存收益相关)

研究结果

复合突变特征(在包含52个候选基因的基因列表中≥2个基因突变)占350例NSCLC患者中的145例,与ICI治疗收益显著相关。列表中≥2个基因突变的NSCLC患者 vs. 无突变患者的中位总生存期(OS)为36个月 vs. 8个月。TMB低(<10muts/Mb)但有复合突变特征的患者 vs. TMB-H但无复合突变特征的患者OS获得显著收益(18个月 vs. 5个月)。最后,在一项由156名接受ICI治疗的NSCLC患者的独立队列中,具有复合突变特征的患者和52个基因无突变的患者的中位无进展生存期(PFS)分别为8.3个月和3.5个月。


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研究结论

52个候选基因中≥2个突变的基因特征在预测NSCLC患者ICI治疗的临床收益方面优于TMB-H。


其他结果与讨论

从文中可以看出该候选基因列表是通过350例NSCLC患者队列中选出对ICI收益更好的52个基因,负荷基因特征设定为≥2个突变(列表中)。在验证队列中PFS同样取得了阳性结果。这样设定获得的阳性结果,仍需要大样本前瞻性研究验证。

还有一个问题是,这些基因是不是因为和患者本身预后相关,而与ICI治疗无关?该问题研究者选取了MSK-IMPACT队列中未接受ICI的NSCLC亚队列进行分析,在不进行ICB治疗的情况下,复合突变组观察到的生存益处未被观察到,并且,复合和单突变组的存活率低于野生型组。(下图)

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此外,研究者还比较了基因突变特征与PD-L1表达在预测ICI疗效的关系,结果复合基因突变特征预测ICI疗效为独立于PD-L1表达。在机制方面,研究者考虑该文中的基因突变特征可能与免疫微环境改变相关,应用了在线工具TIP,使用基于突变特征的CIBERSORT方法,分析了TCGA pan cancer atlas队列的501例NSCLC患者的基因表达数据。结果显示:复合突变特征CD8+T细胞、NK细胞和嗜酸性粒细胞的瘤内浸润显著增加;另一方面,瘤内Treg细胞的数量显著减少。

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参考文献:

1. Pan D, Hu AY, Antonia SJ, Li C-Y, A Gene Mutation Signature Predicting

Immunotherapy Benefits in Non-Small Cell Lung Cancer Patients, Journal of Thoracic Oncology (2021),doi: https://doi.org/10.1016/j.jtho.2020.11.021.


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发表于:2021-01-17 12:12

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