来自于全国的各种疑难或重症肺炎、肺真菌（曲霉、隐球菌）、寄生虫、非结核分枝杆菌（NTM）感染、肺脓肿等超半数，成为我国感染病科中专业化诊治肺部感染的特色科室。其他有原因不明发热、败血症和心内膜炎、手术相关感染、腹腔感染、耐药菌感染等。
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